mardi 13 août 2019

Des chercheurs identifient des sous-types de cancer du poumon à cellules squameuses

Selon une étude menée par H. Lee Moffitt Cancer Center & Research Institute publiée dans Nature Communications, le cancer du poumon est la principale cause de décès par cancer aux États-Unis, le cancer du poumon à cellules squameuses (squamous cell lung cancer, SCC) étant un des types les plus courants. Malgré l'amélioration des connaissances sur les altérations moléculaires du SCC, les chercheurs comprennent mal comment ces altérations contribuent au développement du cancer et comment exploiter les vulnérabilités potentielles pour traiter la maladie. Ces derniers ont analysé de plus près les tumeurs du SCC pour déterminer si leurs caractéristiques avaient un impact sur les résultats pour les patients

Les chercheurs ont effectué une analyse approfondie de 108 échantillons de tumeurs SCC du protocole Total Care Care de Moffitt. Cette analyse comprenait les altérations du nombre de copies, les mutations de l'ADN, les schémas d'expression de l'ARN et des protéines et la pathologie. Ils ont déterminé que les tumeurs SCC pouvaient être regroupées en 3 sous-types principaux en fonction de leurs profils d'expression protéique. Ces sous-types ont été nommés inflammés, rédox et mélangés.

Le sous-type enflammé représentait 40% du tissu tumoral. Ces échantillons présentaient des taux plus élevés de protéines associées aux cellules immunitaires, en particulier les neutrophiles ou les cellules myéloïdes, et une réponse inflammatoire active. Sur la base de données sur l'ARN, les chercheurs ont découvert que le sous-type enflammé présentait également une proportion élevée d'autres cellules immunitaires, notamment les cellules B mémoires et les monocytes, et qu'il était associé à des taux plus élevés de PD-1 que les deux autres sous-types.

Le sous-type redox a été noté dans 47% des tumeurs. Les échantillons étaient caractérisés par des niveaux plus élevés de protéines associées aux voies de signalisation cellulaires d'oxydoréduction. Le sous-type redox présentait également un nombre plus élevé d'altérations génétiques et chromosomiques connues pour être impliquées dans le développement du SCC. En utilisant ces données comme guides, ils ont identifié de nouvelles vulnérabilités qui pourraient constituer de futures cibles thérapeutiques.

Le dernier sous-type, le groupe mixte, représentait 13% des tumeurs et ne présentait qu'un niveau accru de quatre protéines. Les chercheurs n'ont pas trouvé d'altérations chromosomiques significatives dans ce sous-type, mais ont appris que le groupe mixte avait plus de mutations dans le gène APC et avait une infiltration plus importante de cellules stromales que les autres sous-types.

L'analyse a révélé que les trois sous-types ne correspondaient pas à des résultats meilleurs ou pires pour les patients. Cependant, les structures ganglionnaires tertiaires, plus courantes dans le sous-type enflammé, étaient associées à de meilleurs résultats.

Les chercheurs mentionnent, en terminant, que le SCC peut être considéré comme une maladie comportant trois sous-types, dont la majeure partie (87%) est associée à une biologie de l'infiltration immunitaire (inflammation) ou de l'oxydoréduction (rédox).

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