La contribution de la variation génétique au risque de maladie immunitaire

Le rôle de la génétique concernant le risque d'avoir une maladie immunitaire pourrait être ignoré durant la recherche comme le soulignent les scientifiques dans une étude menée par Wellcome Trust Sanger Institute. En utilisant une combinaison de cellules souches et de nouveaux outils analytiques, les scientifiques du Wellcome Sanger Institute ont découvert que les indices de la contribution de la variation génétique au risque de maladie résident non seulement dans les gènes, mais aussi dans les commutateurs moléculaires. 

Les résultats, publiés dans Nature Genetics, révèlent pour la première fois comment les cellules immunitaires créées à partir de cellules souches pluripotentes induites par l'homme peuvent modéliser la variation de la réponse immunitaire entre les personnes.

Les chercheurs ont découvert que les différences dans les réponses immunitaires dues à la variation génétique n'étaient visibles qu'à certaines étapes de l'expérience lorsque les cellules immunitaires étaient dans des états particuliers, par exemple lorsqu'elles étaient activées. Dans d'autres états, seules les «empreintes» des effets de la variation génétique ont pu être observées. Cependant, en examinant deux éléments, les gènes et les régions régulatrices, les commutateurs moléculaires qui contrôlent l'expression de ces gènes, les chercheurs ont pu identifier l'impact réel des différences génétiques sur la réponse immunitaire. Les résultats suggèrent que les effets réels de la variation génétique sur la réponse immunitaire sont souvent cachés s'ils ne sont pas recherchés de manière approfondie. Une compréhension du rôle que jouent les variantes génétiques auprès du système immunitaire contre les maladies serait une étape importante vers des thérapies mieux ciblées comme le soulignent les chercheurs.

Pour l'étude, les scientifiques ont différencié les cellules souches pluripotentes induites par l'homme dans des globules blancs appelés macrophages. Les macrophages ont ensuite été étudiés dans quatre états différents: non stimulés, après 18 heures de stimulation avec une molécule de signalisation interféron-gamma, après cinq heures d'infection par Salmonella, et après stimulation par interféron-gamma suivie d'une infection à Salmonella. 

Les chercheurs ont également découvert que la variation génétique a une incidence sur la capacité des cellules immunitaires à s'attaquer à une infection. En particulier, les cellules immunitaires de certains individus étaient prêtes à traiter l'infection à Salmonella, alors que les macrophages d'autres individus étaient moins prêts et prenaient plus de temps à réagir. Ce niveau de «préparation» était dû à un phénomène connu sous le nom d'amorçage d'amplificateur, où certains des commutateurs étaient déjà activés dans les cellules non stimulées pour faciliter une réponse plus rapide. Dans certains cas, les cellules immunitaires peuvent être trop désireuses et cela peut conduire à une réponse inflammatoire associée à des troubles immunitaires.