mardi 29 septembre 2020

L'évaluation des tests rapides de COVID-19 révèle des niveaux élevés de sensibilité diagnostique

Selon un article paru sur le site de l'University of Sheffield, LamPORE, une nouvelle plate-forme de diagnostic pour la détection du SRAS-CoV-2ARN, combine une amplification isotherme à médiation en boucle avec un séquençage nanoporeux, ce qui signifie qu'il a le potentiel d'analyser des milliers d'échantillons par jour sur un seul instrument.

Bien que préliminaires, les résultats suggèrent des niveaux élevés de sensibilité diagnostique dans LamPORE, ce qui pourrait signifier une extension de l'échelle des tests qui pourraient être proposés à l'avenir pour aider à contrôler la pandémie de SRAS-CoV-2.

Les chercheurs ont utilisé de l'ARN (acide ribonucléique qui est une molécule polymère essentielle à divers rôles biologiques dans le codage, le décodage, la régulation et l'expression des gènes) extrait de deux types d'échantillons. Initialement, des échantillons simulés formés de salive provenant de personnes non infectées auxquelles une quantité connue de virus était ajoutée, puis des prélèvements de nez et de gorge sur de vrais patients COVID-19 prélevés lors de soins de routine dans deux hôpitaux britanniques - Oxford University Hospitals NHS Foundation Trust et Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust.

Les échantillons cliniques positifs provenaient principalement de patients présentant une infection symptomatique, et parmi ceux-ci, LamPORE avait une sensibilité diagnostique de 99,1% (c'est-à-dire qu'il était positif dans 226 des 228 échantillons positifs par RT-PCR).

Parmi les échantillons cliniques négatifs, dont 153 avec d'autres pathogènes respiratoires détectés, LamPORE avait une spécificité diagnostique de 99,6% (c'est-à-dire qu'il était négatif dans 278 des 279
échantillons négatifs par RT-PCR). Dans l'ensemble, 1,4% des échantillons ont produit un résultat indéterminé lors du premier test, et répéter les tests LamPORE sur le même extrait d'ARN avait une reproductibilité de 96,8%.

Ces résultats indiquent que LamPORE a une performance similaire à la RT-PCR pour le diagnostic de l'infection par le SRAS-CoV-2 chez les patients symptomatiques.

 

  

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