Selon une étude menée par l'University of Wisconsin-Madison publiée dans Nature Communications, un arbre généalogique de plus de 200 variations du virus qui cause la COVID-19 aide à expliquer pourquoi deux comtés du Wisconsin - à seulement 120 kilomètres l'un de l'autre, mais loin des origines du virus - ont eu des expériences précoces si différentes avec la pandémie, et montre à quel point les ordonnances de santé publique ont initialement ralenti le taux d'infection.
Fin avril, le comté de Dane avait dénombré 405 infections à coronavirus et 19 décès. Le comté de Milwaukee, avec moins de deux fois plus d'habitants, a eu plus de six fois les infections (2 629) et 126 décès. Mais il y avait peu de transmission virale significative entre les deux comtés, selon une analyse des séquences génomiques d'échantillons de virus prélevés sur des patients infectés dans les comtés de Dane et Milwaukee
En suivant de légères mutations dans les séquences génétiques du virus, les chercheurs savent que les premières introductions du virus dans le comté de Milwaukee provenaient d'Asie et ont commencé à se propager entre les habitants, selon l'étudiant diplômé Gage Moreno, co-auteur de l'étude. Dane, d'autre part, a obtenu ses visiteurs viraux en grande partie d'Europe, et dans un plus grand nombre de variantes distinctes.
Mais, malgré plus d'occasions de relancer la transmission communautaire, le comté de Dane a réussi à éviter le sort de Milwaukee. En fait, le comté de Dane a eu le 12e cas de COVID-19 aux États-Unis, qui est arrivé avec un voyageur de Chine le 30 janvier, mais ne s'est propagé à personne d'autre.
Selon les chercheurs, cela indique d'autres facteurs, et les plus probables sont les différences démographiques et socio-économiques entre les comtés de Milwaukee et de Dane. La population du comté de Milwaukee vit plus près les uns des autres, a un revenu moyen plus faible, est moins susceptible d'avoir accès aux soins de santé et est plus susceptible d'avoir des problèmes de santé tels que l'obésité et le diabète, ce qui pourrait rendre les gens plus vulnérables à l'infection à la COVID-19 et des résultats plus graves.
Les facteurs humains ont changé à la fin du mois de mars lorsque l'ordre de confinement du département des services de santé du Wisconsin a fermé les entreprises non essentielles et interdit les rassemblements. En suivant la propagation de différentes variantes du virus après la promulgation de l'ordonnance, les chercheurs peuvent déterminer dans quelle mesure il a arrêté la propagation en estimant le nombre de reproduction de base du virus, le nombre de nouveaux cas susceptibles de survenir chez une seule personne infectée.
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