mercredi 1 avril 2020

Le virus COVID-19, en chiffres

En 2018, Rob Phillips et ses collaborateurs de longue date, Ron Milo et Yinon Bar-On, ont fait de vastes estimations mondiales quantitatives de la quantité de matière biologique sur la planète, illustrant comment les humains ont un impact disproportionné sur notre environnement.

Or, avec le syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SARS-CoV-2) provoquant une pandémie mondiale, les chercheurs ont utilisé une approche chiffrée afin d'étudier le nouveau virus. Les résultats de la recherche sont publiés dans la revue eLife sur les chiffres clés sous-jacents à COVID-19, soit les concentrations moyennes du virus dans tout le corps, la stabilité du virus sur diverses surfaces, le taux d'infection, notamment.

Selon les chercheurs, un virus est essentiellement un petit conteneur, à l'intérieur duquel se trouvent ses informations génétiques. Ils ont très peu de gènes. Le nouveau coronavirus possède environ 25 gènes. A titre de comparaison, une bactérie possède de l'ordre de 4 000 gènes et un humain possède de l'ordre de 20 000 gènes. Il est fascinant qu'ils aient un énorme impact biologique avec si peu de gènes.

Lors d'une infection, les virus agissent comme des chevaux de Troie. Ils transportent leur matériel génétique dans une cellule hôte et incitent la cellule hôte à fabriquer des centaines ou des milliers de nouvelles copies du virus. Ensuite, les nouveaux virus ont éclaté hors de la cellule, la détruisant, et vont faire de même pour plus de cellules. À ce stade, il s'agit essentiellement d'une guerre entre le virus et le système immunitaire de l'hôte, qui tente de mobiliser une défense et d'éliminer les cellules qui hébergent le virus.

Les données génétiques sont assez intéressantes. Selon les chercheurs, le SRAS-CoV-2 est génétiquement similaire à 50% au coronavirus froid commun et à 96% aux coronavirus des chauves-souris. Ces virus zoonotiques, ceux qui proviennent d'animaux et se transmettent à l'homme, sont là pour rester. Ils font partie de l'histoire humaine.

Ce qui rend difficile la compréhension globale des taux d'infection, c'est qu'il existe également de grandes variations statistiques dans les données. Certaines personnes sont beaucoup plus infectieuses que d'autres, les charges virales hébergées par différentes personnes infectées montrant une énorme variation.

Selon les chercheurs, l'une des difficultés de la recherche sur le SRAS-CoV-2 est qu'il y a tellement de vignettes individuelles. Certaines de ces vignettes sont: la survie des virus sur diverses surfaces, la biologie structurale de la protéine de pointe à la surface du virus, la microscopie électronique des éléments structurels du virus, la biologie cellulaire de la façon dont le virus interagit avec son hôte, etc.



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