Selon une étude menée par Brigham and Women's Hospital publiée dans EBioMedicine, une détection précoce et précise est essentielle pour prévenir la propagation de la COVID-19. Les écouvillons nasopharyngés (Nasopharyngeal, NP), qui nécessitent l'insertion d'une longue tige dans la cavité nasale pour prélever un échantillon à l'arrière du nez et de la gorge, sont actuellement la référence absolue pour la collecte d'un échantillon à des fins de diagnostic. Cpendant, la procédure est techniquement difficile, souvent inconfortable pour les patients et nécessite des équipements de protection individuelle qui peuvent être rares. D'autres méthodes de prélèvement d'échantillons ,y compris à partir d'un écouvillon oropharyngé et de crachats, ont été testées dans de petites études, mais il existe une incertitude quant à la meilleure méthode pour détecter le virus.
Les chercheurs ont mené une revue systématique et une méta-analyse, analysant les données de plus de 3000 échantillons pour comparer les trois approches.Ces derniers ont constaté que les tests d'expectoration détectaient l'ARN du virus qui cause la COVID-19 à des taux significativement plus élevés, tandis que les tests sur écouvillon oropharyngé avaient des taux plus faibles. Quelle que soit la méthode de collecte, les échantillons précoces ont été prélevés après le début des symptômes, plus le taux de détection est élevé.
Les chercheurs ont parcouru la littérature, à la fois des pré-impressions et des articles publiés, pour des études qui évaluaient au moins deux sites d'échantillonnage respiratoire à l'aide d'un écouvillon NP, d'un écouvillon oropharyngé ou de crachats. De plus de 1 000 études, ils ont identifié 11 qui répondaient à leurs critères. Ces études comprenaient les résultats d'un total de 3442 échantillons des voies respiratoires.
Les chercheurs ont analysé la fréquence à laquelle chaque méthode de collecte produisait un résultat positif. Pour les écouvillons NP, le taux était de 54 pour cent; pour les écouvillons oropharyngés, 43 pour cent; pour les expectorations, 71 pour cent. Le taux de détection virale était significativement plus élevé dans les expectorations que les écouvillons oropharyngés ou les écouvillons NP. Les taux de détection étaient les plus élevés dans la semaine suivant l'apparition des symptômes pour les trois tests.
Des écouvillons nasopharyngés sont prélevés dans la cavité nasale; des écouvillons oropharyngés sont prélevés en insérant une tige à travers la bouche; et des échantillons de crachats sont généralement prélevés en faisant tousser profondément un patient pour produire et expulser des mucosités. Tous les patients ne sont pas en mesure de produire un échantillon de crachats; pour ces patients, un prélèvement nasopharyngé peut être la meilleure méthode de prélèvement. La méta-analyse ne comprenait que des études menées sur des personnes hospitalisées - une étude supplémentaire sera nécessaire sur les patients asymptomatiques ou présentant des symptômes légers. L'étude actuelle n'a pas évalué les méthodes de test alternatives, telles que la salive ou les prélèvements nasaux antérieurs (prélevés de l'avant du nez).
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