La nouvelle variante de la COVID-19 se développe rapidement en Angleterre

Selon une étude menée conjointement par l'Imperial College London, l'University of Edinburgh, Public Health England (PHE), Wellcome Sanger Institute, l'University of Birmingham et COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium+ publiée en ligne, la nouvelle variante SARS-CoV-2 se développe rapidement, est plus transmissible que les autres variantes et affecte une plus grande proportion de moins de 20 ans. La nouvelle variante a un avantage de transmission de 0,4 à 0,7 en nombre de reproduction par rapport à la souche précédemment observée



Selon les chercheurs, tous les virus subissent des modifications génétiques appelées mutations et, par la pression de sélection, peuvent aboutir à des variantes différentes. La variante du SRAS-CoV-2 (le virus responsable de la COVID-19), initialement appelée lignée B.1.1.7, a été détectée en novembre 2020 et se propage rapidement à travers l'Angleterre. Plusieurs changements génétiques (substitutions et délétions) ont une signification immunologique et sont associés à des échecs des tests de diagnostic. L'absence de cible du gène S dans un test PCR par ailleurs positif semble être un marqueur très spécifique pour la lignée B.1.1.7, qui a maintenant été désignée Variant of Concern (VOC) 202012/01 par Public Health England.



À l'aide de diverses approches statistiques, les chercheurs ont évalué la relation entre la transmission et la fréquence de la nouvelle variante à travers les régions du Royaume-Uni au fil du temps. En utilisant la prévalence du génome entier de différentes variantes génétiques à travers le temps et la modélisation phylodynamique (dynamique des processus épidémiologiques et évolutifs), les chercheurs montrent que cette variante se développe rapidement.

L'étude trouve une corrélation élevée entre la fréquence des COV et ce qu'on appelle l'échec de la cible du gène S (SGTF) dans les tests PCR de routine des cas communautaires. Cela a permis aux chercheurs d'utiliser la fréquence SGTF comme une estimation de l'occurrence des COV et des non-COV par région au fil du temps, montrant que la fréquence des COV est associée à la croissance épidémique dans presque toutes les zones.

Il existe un consensus parmi toutes les analyses sur le fait que le COV a un avantage de transmission substantiel (transmission accrue par rapport au non-COV), avec la différence estimée des nombres de reproduction entre COV et non-COV variant entre 0,4 et 0,7, et le rapport des nombres de reproduction variant entre 1,4 et 1,8. Ces niveaux d'infection plus élevés ont eu lieu malgré les niveaux élevés de distanciation sociale en Angleterre. L'extrapolation à d'autres contextes de transmission nécessite de la prudence, notent les chercheurs.



L'étude révèle que les personnes de moins de 20 ans représentent une proportion plus élevée de cas de COV que de cas sans COV. Cependant, il est trop tôt pour déterminer le mécanisme derrière ce changement selon les chercheurs. Ils expliquent qu'il a peut-être été en partie influencé par la propagation des variantes coïncidant avec une période où le confinement était en vigueur mais les écoles étaient ouvertes. Des recherches supplémentaires sont en cours sur la nature spécifique de tout changement dans la façon dont le virus affecte ce groupe d'âge.