mardi 31 mars 2020

Covid 19, modélisation et mortalité

Deux études récemment publiées dans la revue en libre accès PLOS ONE permettent de voir un peu plus clair concernant l'éclosion de coronavirus COVID-19. Dans la première étude, publiée le 31 mars 2020, les chercheurs ont utilisé un modèle SIRD (Susceptible-Infected-Recovered-Dead) calibré avec les données déclarées entre le 11 janvier et le 10 février 2020. Ces derniers ont prévu l'évolution de l'épidémie dans l'épicentre de l'épidémie, Hubei, Chine jusqu'au 29 février. Avec ces paramètres, ils ont prévu qu'au moins 45 000 seraient infectés et 2 700 mourraient d'ici le 29 février - en fait, au Hubei, environ 67 000 sont connus pour avoir été infectés, tandis que le nombre de morts était d'environ 2800 pendant cette période.

Les chercheurs ont également utilisé le modèle SIRD pour estimer la valeur R0 de COVID-19, une estimation de la contagiosité qui reflète le nombre moyen de personnes susceptibles d'attraper une infection d'une personne contagieuse. Dans divers scénarios, leur estimation de R0 sur la base des données disponibles était d'environ 2,5. En supposant un degré élevé de sous-déclaration des cas bénins de COVID-19 dans leurs données, ils ont estimé un taux de mortalité dans la population totale d'environ 0,15% pour le virus. En outre, sur la base d'un scénario supposant une échelle de 20 fois le nombre de personnes infectées dans la population totale, leur étude a prédit une baisse de l'épidémie fin février dans le Hubei. En effet, au cours des derniers jours, le nombre de nouveaux cas infectés a considérablement diminué.

Dans la deuxième étude, publiée le 19 mars 2020, les chercheurs ont étudié 27 patients infectés par COVID-19 et admis à l'hôpital central de Wuhan. Dans ce groupe de patients, les chercheurs ont associé les caractéristiques cliniques identifiées à partir de tomodensitométrie (CT) des poumons des patients avec des résultats éventuels. Ils ont évalué les patients en fonction des caractéristiques qu'ils ont observées, telles que l'opacité du verre dépoli, une anomalie des deux côtés et une distribution étendue de la pathologie dans les poumons, afin de produire un score de gravité global pour chaque patient.

Sur les 27 patients, qui étaient pour la plupart des adultes plus âgés (âge médian de 60 ans), 17 (63%) se sont rétablis et sont sortis de l'hôpital, tandis que 10 (37%) sont décédés du virus. Les patients présentant des problèmes de santé sous-jacents, notamment l'hypertension, le diabète et les maladies cardiaques, étaient plus susceptibles de mourir du virus que les patients sans ces comorbidités, et les patients plus âgés étaient également plus susceptibles de mourir, bien qu'il n'y ait pas de différence entre les sexes. Les patients avec un score plus élevé (plus sévère) au scanner étaient beaucoup plus susceptibles de mourir du COVID-19 - le score moyen des patients décédés était de 30, contre 12 chez les patients qui se rétablissaient.

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