Comme nous avons pu le constater depuis quelques semaines déjà, le SRAS-CoV-2 est hautement infectieux et peut provoquer une pneumonie grave avec détresse respiratoire (COVID-19). Selon un article publié dans Science, des chercheurs de Helmholtz Association of German Research Centres ont maintenant trouvé une approche prometteuse. En utilisant la lumière à rayons X à haute intensité de la source synchrotron de Berlin BESSY II, ils ont décodé l'architecture tridimensionnelle de la principale protéase du SARS-CoV-2. Selon les chercheurs, cette protéine est impliquée dans la reproduction du virus. L'analyse de son architecture 3D permet le développement systématique de médicaments inhibant la reproduction du virus.
Comme le soulignent les chercheurs, l'analyse structurale des protéines fonctionnelles du virus est très utile pour atteindre cet objectif. La fonction d'une protéine est étroitement liée à son architecture 3D. Si cette architecture 3D est connue, il est possible d'identifier des points d'attaque spécifiques pour les substances actives.
Une protéine spéciale est responsable de la reproduction des virus: la principale protéase virale (Mpro ou encore 3CLpro). Les chercheurs ont maintenant décodé l'architecture 3D de la principale protéase du SARS-CoV-2. Les chercheurs ont utilisé la lumière à rayons X à haute intensité de l'installation BESSY II de l'Helmholtz-Zentrum Berlin.
Sur les soi-disant instruments MX, de minuscules cristaux de protéines peuvent être analysés avec une lumière X très brillante. Les images contiennent des informations sur l'architecture 3D des molécules de protéines. La forme complexe de la molécule de protéine et sa densité électronique sont ensuite calculées par des algorithmes informatiques.
L'architecture 3-D fournit des points de départ concrets pour le développement de substances actives ou d'inhibiteurs. Ces médicaments pourraient s'arrimer spécifiquement pour cibler des points de la macromolécule et entraver sa fonction.
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