Selon une étude menée par Charité - Universitätsmedizin Berlin publiée dans Science, les chercheurs ont analysé les échantillons PCR de plus de 25 000 personnes atteintes de COVID-19. Ces derniers ont déterminé les charges virales de chaque échantillon individuel et a utilisé leurs résultats pour estimer les niveaux d'infectiosité. La recherche donne une idée claire de l'infectiosité de la maladie dans différents groupes d'âge et à différents niveaux de gravité de la maladie. Il fournit également de nouvelles informations sur la variante B.1.1.7.
Selon le numéro de reproduction (R 0), une personne infectée par le SRAS-CoV-2 transmettra, en moyenne, son infection à trois à cinq autres personnes. Bien qu'il s'agisse d'une mesure utile dans un contexte épidémiologique, «R 0» ne se prête pas à l'estimation du risque de transmission au niveau de l'individu ou du groupe. Une fois que les facteurs sociaux et environnementaux normaux sont éliminés de l'équation, les individus peuvent différer considérablement en termes de leur infectiosité et de la durée pendant laquelle ils excrètent activement le virus.
Afin de mieux comprendre et estimer l'infectiosité dans des groupes spécifiques d'individus, les chercheurs ont analysé les échantillons de PCR de plus de 25 000 cas de COVID-19 afin de déterminer leur «charge virale». La charge virale d'un échantillon, le nombre total de copies du génome du SRAS-CoV-2 contenues dans l'échantillon, fournit une estimation approximative de la quantité de virus présente dans la gorge d'un patient et, en tant que telle, constitue une mesure utile pour estimer celle d'un individu. infectiosité. Pour améliorer encore leurs estimations, les chercheurs ont également appliqué les résultats concernant le seuil de charge virale minimum généralement requis pour l'isolement réussi du SRAS-CoV-2 en culture cellulaire (où l'isolement indique la présence d'un virus infectieux). Des échantillons séquentiels étaient disponibles pour plus de 4 300 des cas étudiés. En les utilisant pour suivre les données de charge virale de la gorge au fil du temps, les chercheurs ont pu modéliser le développement typique des charges virales au cours de l'infection. Les chercheurs ont ensuite recherché des différences significatives dans leurs données, en particulier en ce qui concerne les différents groupes d'âge, la gravité de la maladie et les variantes du virus.
Aucune différence notable dans les niveaux de charge virale n'a été enregistrée chez les individus positifs au SRAS-CoV-2 âgés de 20 à 65 ans, l'échantillon moyen sur écouvillon de gorge contenant environ 2,5 millions de copies du génome du SRAS-CoV-2. Les charges virales étaient les plus faibles chez les très jeunes enfants (de 0 à 5 ans). Les niveaux ont commencé à environ 800 000 copies du génome viral, ont augmenté avec l'âge et se sont rapprochés des niveaux adultes chez les enfants plus âgés et les adolescents.
En comparant les charges virales maximales dans les échantillons de laboratoire, les chercheurs ont estimé que les niveaux d'infectiosité chez les plus jeunes enfants (0 à 5 ans) étaient d'environ 80% de ceux trouvés chez les adultes. Comme précédemment, les valeurs des enfants et des adolescents d'âge scolaire se rapprochaient des valeurs des adultes.
Une comparaison basée sur les symptômes a confirmé les observations précédemment faites dans les cas de COVID-19, à savoir que même les individus asymptomatiques peuvent avoir des charges virales très élevées. Les personnes qui ont dû être hospitalisées avaient une charge virale plus élevée que les autres pendant toute la durée de la maladie. Sur la base de leurs nouveaux modèles d'évolution de la charge virale au fil du temps, les chercheurs estiment que les personnes infectées par le SRAS-CoV-2 atteignent un pic de charge virale dans la gorge dès 1 à 3 jours avant l'apparition des symptômes.
Environ 9% des cas de COVID-19 testés ont montré des charges virales extrêmement élevées d'un milliard de copies par échantillon ou plus. Plus d'un tiers de ces personnes potentiellement hautement infectieuses n'avaient aucun symptôme ou seulement des symptômes bénins.
Dans les échantillons prélevés sur des individus infectés par la variante B.1.1.7 (`` UK '' ou `` britannique ''), les charges virales moyennes se sont révélées être augmentées d'un facteur dix, tandis que les estimations de l'infectiosité basées sur le laboratoire étaient augmentées d'un facteur du 2.6. Pour arriver à ces données, les chercheurs ont pris les données de charge virale d'environ 1500 cas infectés par B.1.1.7 et les ont comparées aux données d'environ 1000 personnes infectées par d'autres variantes qui avaient été testées dans les mêmes centres de test, services ambulatoires et cliniques. salles à peu près au même moment.
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