Les séquences protéiques fournissent des indices sur la façon dont le SRAS-CoV-2 infecte les cellules

Selon une étude menée par European Molecular Biology Laboratory publiée dans Science Signaling, durant les premiers jours de la pandémie COVID-19, il a été établi que le SRAS-CoV-2 infecte les cellules en se liant à la protéine humaine ACE2, qui joue un rôle dans la régulation de la pression artérielle. Or, ACE2 est presque absent des cellules pulmonaires humaines. Cela a donné aux chercheurs un indice que l'ACE2 pourrait être plus qu'un simple régulateur de pression artérielle, et pourrait ne pas être le seul acteur du mécanisme d'infection par le SRAS-CoV-2

Les chercheurs ont analysé les séquences d'ACE2 et d'autres protéines humaines impliquées dans l'infection par le SRAS-CoV-2, comme une classe de protéines appelées intégrines. Ils se sont concentrés sur de courtes chaînes d'acides aminés appelés motifs linéaires courts (SLiM), qui sont impliqués dans la transmission d'informations entre l'intérieur et l'extérieur des cellules. L'identification et la comparaison rapides des SLiM ont été possibles grâce à la ressource Eukaryotic Linear Motif (ELM), la plus grande base de données de SLiM organisée, que l'équipe et ses collaborateurs développent depuis 20 ans.

Ils ont vu que l'ACE2 et plusieurs intégrines contiennent des SLiM qui sont probablement impliqués dans l'endocytose et l'autophagie - processus cellulaires d'absorption et d'élimination des substances, respectivement. Ce résultat suggère des rôles jusqu'alors inconnus de l'ACE2 et des intégrines dans la physiologie cellulaire. Selon les chercheurs, les interactions protéiques prédites et vérifié que ces interactions sont régulées par l'ajout naturel d'ions contenant du phosphore